本系隸屬於農業暨自然資源學院。本校的教育目標為「培育兼具人文與科學素養、溝通與創新能力、國際視野與社會關懷之菁英人才。」,而本院的教育目標為「培育農業生產科學、自然資源經營管理與保育、農村社群發展之專業,兼具整合、創新能力及國際觀之現代青年」。為因應產業結構變遷,配合國家經濟建設,因應時代需要,造就具有理論基礎與實用技術的動物科技人才。