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Po-Ying Fu

曾任聖路易斯華盛頓大學生物資訊分析師,專長為罕見疾病遺傳分析。

生物 X 資訊跨領域學習資料分析,對不同事物保持高度好奇心,願意踏出舒適圈嘗試與體驗。

2015年獨自單車環島與單車旅歐,透過旅行認識來自各地的朋友,鍛鍊自己的適應能力;也是因為這段經歷,讓自己能進一步鼓起勇氣跨領域學習與探索。

積極參與社群,樂於分享所學,曾任 PyLadies Taipei 與 Woman Who Code Taipei 義工與講師。

資料分析師.生物資訊分析師
Taichung,TW

[email protected]

Skills


Programming Language

  • Bash Script (5+ years)
  • Python (3+ years)
  • Java, Go, C/C++
  • JavaScript, HTML5/CSS


Tools

  • Docker
  • Git
  • Tableau and Power BI
  • PostgreSQL
  • SPSS Modeler
  • Experience in GCP and AWS


Bioinformatics

  • GATK and Hail (PySpark tool)
  • BWA, PLINK, Parabricks
  • Germline SNV/Indel, SV/CNV
  • Working on HPC, LSF Cluster
  • Workflow Management Tools - Snakemake, CWL/WDL

Experience

Washington University School of Medicine Department of Genetics
Bioinformatics Research Analysis, Sep 2020 - now

主要參與罕見疾病臨床基因體資料分析。負責建立實驗室分析管道、實做期刊中的新分析方法、訓練並協助博士生做資料分析。由於資料量日漸龐大,我們引進 GPU 加速的 Parbricks 與 PySpark tool - Hail 取代舊有工具處理 TB 級資料。
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中研院 資訊所 研究助理, May 2018 - July 2019

主要參與 genome de novo assembly 與 metagenomic 專案。負責資料分析與視覺化,研究提昇完整度的演算方法。
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聯合報系 數據發展部 資料分析師, June 2016 - Jul 2017

部門隸屬 UDN Group 總管理處旗下,協助集團各事業單位專案分析及廣告投放,任職期間主要負責項目為:

  • EDM 精準行銷廣告案精準投放:開信率保持三成左右,發送基礎點閱率也有 3% 水準。
  • 集團內部自動化 BI 系統建置:從使用者需求調查到正式上線,透過資料庫串連、API 建置以及資料視覺化,提供更簡潔有效率的方式呈現每日最新數據。
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台北榮總皮膚部 陳志強醫師實驗室, Mar 2013 - Mar 2015

模式小鼠皮膚幹細胞的活化研究。DNA/RAN 萃取、細胞培養、動物實驗。

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Education

Ohlone College, Computer Science, Aug 2019 - Aug 202

Unix basic command, C programming and rewrite libraries, Data Structures.

清大 高等資料庫&資料探勘, Sep 2017 - Jan 2018

採隨班附讀方式參與碩士班課程(英語授課):

  • Advanced Database Systems, 2017 Fall, Yi-Shin Chen : Grade A+
  • Data Mining: Concepts, Techniques, and Applications, 2017 Fall, Yi-Shin Chen : Grade B+

資策會 巨量資料分析就業養成班, Oct 2015 - May 2016

課程包含 Linux, Java, Hadoop Ecosystem, Database, Data Analytics, Interactive Representation 等六大項,課程總時數 600 小時。

東吳大學 微生物所, Sep 2010 - Feb 2013

進入生物資訊暨分子生物實驗室。

畢業論文:脂多醣結合胜肽的抗癌能力

東吳大學 微生物系, Sep 2006 - Jun 2010

進入微生物遺傳實驗室,主要學習培養高溫嗜酸溫泉菌及 DNA cloning 等實驗操作。

志工經驗

MLCC for Women,2019 年 1 月 - 2019 年 7 月

MLCC for Women - 非技術女生專場講師 link

MLCC for TMU - 非技術專場講師 link

Pyladies Taipei,2017 年 7 月 - Present

協助活動報到,並擔任課程助教與講師。