(碩士論文) 加速新生嬰兒腦部分割:利用多模態數據的深度學習方法

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(碩士論文) 加速新生嬰兒腦部分割:利用多模態數據的深度學習方法

國立成功大學數據科學所 碩士
Tainan City, Taiwan

加速新生嬰兒腦部分割:利用多模態數據的深度學習方法

Accelerating Neonatal Brain Segmentation: A Deep Learning Approach Using Multimodality Data

專案目標:

  • 解決 dHCP pipeline 分割耗時、不穩定的問題。
  • 減少臨床專業人士手動修正腦區分割的人力成本。
  • 深度學習分類中對於類別不平衡導致的分割誤差。


為了解決上述問題,提出了基於分層架構學習的 Hierarchical Detail Network HiDeNet),實現方法如:

  • 使用不同來源的數據集進行模型的訓練與推理,避免人工標記成本。
  • 影像處理技術解決跨數據集挑戰。
  • 分層式的學習架構更好的學習腦部分區。
  • 使用加權損失函數解決類別不平衡的問題。


研究貢獻:

  • 主要分割腦區數量為 87 區,並同時可以取得以組織等級區分出的 8 個腦區。
  • 對於單一個案的分割速度從 30 分鐘(dHCP)減少至 118 秒
  • 每個腦區平均 Dice 相似係數準確率高達 75 %,mIOU 則是在 62 %,高於現有腦部分割模型。
  • 小腦、腦室等區域分割準確率高於 dHCP pipeline 其他 SOTA 模型


 
本研究提出一種針對新生兒腦部 MRI 影像的分層式細節網路,以簡單的 3D U-Net 結構實現 87 個大腦腦區分割的目標。
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Published: Mar 19th 2024
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